“实用生物信息学”研讨班通知
日期
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授课题目
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授课内容
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第一天 | 生物信息学导论 |
1.生物信息学发展简史(重点讲解)
2.生物信息学主要研究领域(重点讲解)
3.生物信息学软件和工具
4.生物信息学重要会议
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生物信息学基础(上机操作)
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1、linux基础
掌握Linux系统下的常用命令(重点)
掌握linux环境下软件的安装使用
了解shell脚本的编写
2、perl基础
介绍Perl 的基本元素
Perl在生物信息中应用示例(DNA复制、DNA转录、RNA翻译)
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第二天 | 二代测序技术原理及基因组拼接 |
1、介绍目前主流二代测序仪的测序原理
2、主要操作流程及特点
3、序列拼接的技术方法
4、常用软件及全基因组个性化组装的技巧
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基因组拼接组装(以细菌/病毒为例)(上机操作)
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1、全基因组组装的流程介绍
2、原始测序数据的预处理
3、分别介绍Velvet和SOAPdenovo的使用,并以一株细菌的测序数据为例进行组装
4、介绍Newbler的是使用,并以一个IonTorrent测序的噬菌体数据为例进行组装
5、以细菌的数据为例,介绍填补gap的方法,包括延伸法,局部拼接法
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第三天 | 基因组重测序与数据分析 |
1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用
2、结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识
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基因组重测序数据分析实例(上机操作) |
1、对二代测序数据的解读
2、数据质量控制及数据过滤
3、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化(重点讲解)
4、寻找SNP和Indel并进行注释(重点讲解)
5、寻找结构变异并对变异进行注释(重点讲解)
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第四天 | 转录组测序与数据分析 |
1、转录组基本概况和技术发展简介
2、转录组技术流程及技术细节(重点讲解)
3、转录组应用案例
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转录组数据分析实例(上机操作) |
1、转录组数据准备和软件介绍及安装
2、转录组数据的比对(重点讲解)
3、表达量估计和分析(重点讲解)
4、后续功能分析简介
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第五天 |
microRNA测序与数据分析
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1、microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义
2、microRNA的生物学过程(重点讲解)
3、microRNA的测序(重点讲解)
4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解)
5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景
6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)
7、近期文献
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microRNA数据分析实例(上机操作)
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1、microRNA测序数据预处理(重点讲解)
2、测序数据长度分布计算
3、microRNA的预测(重点讲解)
4、microRNA碱基偏好性计算
5、microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)
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蛋白质组信息学平台及应用 |
1、蛋白质鉴定的质量控制
2、非限制性蛋白质翻译后修饰鉴定
3、蛋白质定量分析
4、蛋白质组数据管理
5、案例分析
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报名种类
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优惠对象
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注册费①/折扣
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赠送计算资源包月套餐②
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A
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在校学生(需学生证)
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4950元/9折
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1个月(价值3.5万元)+终身VIP会员③
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B
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工作人员
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5500元
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2个月(价值7万元)+终身VIP会员
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会议时间 | 2015-05-25至2015-05-29 |
会议地点 | 北京海淀区 |
主办单位 | 北京市计算中心生物计算事业部 |
联系人 | 员丽丽 |
电话 | 010-59341773 |
yuanll@bcc.ac.cn | |
官方网址 | http://http://bioc.bcc.ac.cn/bcc/China/shengwuxinxipeixun/2013-12-09/47.html |
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