生物信息软件与数据应用精讲班
时间
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课程名称
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课程内容
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备注
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第一天
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生物信息与数据库
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1、生物信息学概述;
2、NCBI数据库与基因组数据;
3、数据上传提交与批量下载;
4、实例讲解与练习;
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理论+上机
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序列处理与比对
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1、Bioedit与生物信息序列处理;
2、Blast与序列检索比对及参数;
3、Blast建库与Blast本地化;
4、实例讲解与练习;
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上机
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第二天
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分子进化
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1、分子进化理论基础;
2、Mega与系统发育树构建:同源序列比对;分子距离计算;模型选择;不同类型的进化树构建及评价;进化树的结果图查看与修饰等;
3、实例讲解与练习;
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上机为主
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生物统计
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1、生物统计概述;
2、Excel统计模块使用;
3、SPSS使用与生物统计应用;
4、实例讲解与练习;
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理论+上机
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第三天
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基因组注释
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1、GO注释与KEGG生物学通路;
2、David与基因注释;
3、实例讲解与练习;
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理论+上机
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3D结构
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1、生物大分子3D结构概述与数据库;
2、PyMol与生物大分子3D结构展示与分析;蛋白靶向位点分析;3D结构比对;
3、实例讲解与练习;
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上机为主
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16:30~17:00自主练习与交流讨论
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会议时间 | 2015-10-28至2015-10-30 |
会议地点 | 北京 |
主办单位 | 北京市计算中心生物计算事业部 |
联系人 | 员老师 |
电话 | 010-59341773 |
yuanll@bcc.ac.cn |
声明:
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